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【欧洲杯直播预告 】生物图像数据驱动的物理学研究-肿瘤内细胞成序的机制

2019年09月18日 00:00  点击:[]


报告专家:李雪飞

报告时间:927号下午1600
报告地点:行健楼437会议室

报告摘要:

  众所周知,肿瘤是一个多类细胞组成的复杂系统。物理学的研究模式,可以帮助揭示该复杂体系的关键相互作用。在肿瘤内,多类细胞有序排布,更重要的是,这种细胞序对癌症的发展可以起到关键的作用。围绕肿瘤内的细胞序,我将介绍以下两方面的工作。
  首先,通过物理模型研究,揭示细胞液晶序的形成机制。在实体肿瘤内,成纤维细胞环绕包裹着肿瘤细胞团簇。同时,在体外细胞培养实验中,在相对宽阔的准二维通道内,这些成纤维细胞最终可自组织形成完美的液晶序。通过物理模拟椭圆形自驱动“细胞”在二维平面上的动力学过程,我们证明,细胞与其自分泌的外基质纤维网络的相互作用,是细胞长程液晶序形成的关键。
  其次,通过将图像数据的定量分析与物理模型研究相结合,揭示免疫细胞空间分布的物理生物机制。对于多种癌症类型,特定的免疫细胞在肿瘤内的侵入程度越高,患者的生存期越长。通过定量分析了肿瘤切片图像数据,定量刻画了细胞毒性 T 淋巴细胞的空间分布特征。进一步的,以这些定量的统计特征为出发点,通过构建并分析一系列基于反应-扩散方程的物理模型,阐明了限制相关 T 细胞入侵肿瘤的排斥物机制。
  综上所述,我们的工作揭示了肿瘤内多类细胞有序分布背后的物理机制,并为开发新的肿瘤治疗策略提供了理论支撑。

 
[1]Xuefei Li, Rajesh Balagam, Ting-Fang He, Peter P. Lee, Oleg A. Igoshin, and Herbert Levine. On the mechanism of long-range orientational order of fibroblasts. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2017, 114(34): 8974-8979.
[2]Xuefei Li, Tina Gruosso, DongmeiZuo, Atilla Omeroglu, Sarkis Meterissian, Marie-Christine Guiot, Adam Salazar, Morag Park, and Herbert Levine. Infiltration of CD8+ T cells into tumor cell clusters in triple-negative breast cancer. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2019, 116(9): 3678-3687.

 
报告人简介:李雪飞,中科院深圳先进技术研究院合成生物研究所副研究员,本科毕业于浙江大学物理系,于2008年至2012年在香港浸会大学攻读博士,主要从事细菌代谢网络以及利用细菌治疗肿瘤的理论研究。博士后阶段,进入美国莱斯大学的理论生物物理研究中心,从事肿瘤微环境的理论研究。在莱斯大学期间(2015-2019),发表第一作者文章4篇,其中包括2PNAS。李博士的专业特长主要是对生物系统的数理建模分析,以及对生物数据的定量分析。

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